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實驗流程
檢測范圍
16s panel與常規(guī)16s rRNA測序設(shè)計特定保守區(qū)檢測不同,通過對16s rRNA核糖體全長(1.5K)進行引物設(shè)計(依托Ion AmpliSeq設(shè)計引物)降低測序長度與二代測序相匹配。因為常規(guī)的16s rRNA檢測的保守區(qū)設(shè)計的長度最長到500bp,二代測序無法測通的情況下容易產(chǎn)生種屬鑒別不準(zhǔn),且選擇某些保守區(qū)會存在種屬的偏好性,故從全長設(shè)計引物擴增,對于微生物的鑒定會有更好的效果。
具體的21種微生物
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